Jan Kilian ukończył Wydział Budowy Maszyn Politechniki Gdańskiej, studia podyplomowe na Akademii Rolniczo-Technicznej w Olsztynie w zakresie szacowania nieruchomości oraz w zakresie zarządzania i obrotu nieruchomościami, a później także Studium Farmaceutyczne w Gdańsku.
W 2005 roku Jan Kilian związał się z Prawem i Sprawiedliwością - w Starogardzie Gdańskim stanął na czele miejskich i powiatowych struktur partii. W wyborach parlamentarnych w 2015 roku z ramienia PiS uzyskał mandat posła.
Jan Kilian w Sejmie zabiegał głównie o sprawy związane z tożsamością i historią Polski. Podczas jednego z wystąpień powiedział, że "polityk powinien kochać tych, którzy są powierzeni jego trosce".